La bandera de Madeira tiene tres franjas verticales, la franja central es de color amarilla y las exteriores de color azul. En el centro de la bandera y sobre la franja amarilla aparece la Cruz de la Orden de los Caballeros de Cristo (uno de los emblemas de Portugal que conmemora la época de los descubrimientos), de borde rojo y fondo blanco.

El color azul representa el mar y el amarillo el color de la arena de las playas. La cruz refiere a la época de colonización de la isla.